Organske perokside je mogoče uporabiti za kemično sintezo zaradi njihove enostavne razgradnje. Pri tem ustvarjajo koristne proste radikale, ki lahko sprožijo polimerizacijo za proizvodnjo polimerov, modificirajo polimere s cepljenjem ali razpokanjem za zmanjšanje viskoznosti ali zamrežijo polimere za proizvodnjo termoreaktivnih materialov. Pri uporabi v te namene so peroksidi močno razredčeni, zato toploto, ki nastane pri eksotermni razgradnji, varno absorbirajo okoliški mediji (kot so polimerne spojine ali losjoni). Ko pa so peroksidi v čistejši obliki, se toplota, ki nastane pri njihovi razgradnji, morda ne bo razpršila tako hitro, kot se, kar vodi do povišanja temperature in nadaljnje pospešitve eksotermne razgradnje. To lahko povzroči nevarno situacijo, imenovano samopospeševalna razgradnja. Do samopospešene razgradnje pride, ko je stopnja razgradnje peroksidov zadostna za ustvarjanje toplote hitreje od hitrosti, s katero se razpršijo v okolje. Temperatura je glavni dejavnik, ki vpliva na hitrost razgradnje. Najnižja temperatura, pri kateri pride do samopospešene razgradnje pakiranih organskih peroksidov v enem tednu, je opredeljena kot temperatura samopospešene razgradnje (SADT).
Šteje se, da vsaka peroksidna skupina vsebuje en atom aktivnega kisika. Koncept vsebnosti reaktivnih kisikovih vrst pomaga primerjati relativno koncentracijo peroksidnih skupin v formulah, ki je povezana z vsebnostjo energije. Na splošno se vsebnost energije povečuje s povečanjem vsebnosti aktivnega kisika, zato večja kot je molekulska masa organskih skupin, nižja je vsebnost energije in običajno manjša škoda. Izraz reaktivne kisikove vrste se uporablja za označevanje količine peroksida, prisotnega v katerem koli pripravku organskih peroksidov. En atom kisika v vsaki peroksidni skupini velja za aktivnega. Teoretično količino reaktivnih kisikovih zvrsti lahko opišemo z naslednjo enačbo: A [O] teoretična vrednost (odstotki)=16p/m × 100, kjer je p število peroksidnih skupin v molekuli, m pa molekulska masa čistega peroksida. Organski peroksidi se običajno prodajajo v formulah, ki vsebujejo enega ali več desenzibilizatorjev. Z drugimi besedami, zaradi varnosti ali učinkovitosti se lastnosti pripravkov organskih peroksidov običajno spremenijo z uporabo dodatkov za desenzibilizacijo (desenzibilizacijo), stabilizacijo ali kako drugače izboljšajo organske perokside za komercialno uporabo. Komercialne formulacije so včasih sestavljene iz mešanic organskih peroksidov, ki so lahko desenzibilizirani ali ne.